- b -

• backbone_stub_match() : protocols::motifs
• backrub_rotation_angles() : protocols::backrub
• backrub_rotation_constants() : protocols::backrub
• bad_anchorfile() : protocols::anchored_design
• base_atoms_square_deviation() : protocols::stepwise::modeler::rna
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• basic_idealize() : protocols::idealize
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• BOGUS_ASSIGNMENT() : protocols::noesy_assign
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• bond_angles() : protocols::environment
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• bools_from_sizes() : protocols::motifs
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• bump_grid_to_enclose_pose() : protocols::match
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• buried_unsat_hbond_filter_tracer() : protocols::simple_filters