- v -

• validate_loop_start_stop() : protocols::loops
• valide_include_only_stage() : protocols::scoring::methods::pcs2
• VDW_FRAG_STORE() : protocols::loops::loop_closure::ccd
• vec3_to_stub() : protocols::sic_dock
• vector_vector_to_FArray2() : protocols::seeded_abinitio , protocols::toolbox
• verify_stage_ID() : protocols::abinitio::abscript
• vertex_exists() : protocols::forge::methods
• viewer_main() : protocols::viewer
• virtualize_bulges() : protocols::farna
• virtualize_free_rna_moieties() : protocols::stepwise::modeler::rna
• virtualize_o2prime() : protocols::stepwise::legacy::modeler
• virtualize_side_chains() : protocols::stepwise::modeler
• visit_atomtree_node() : protocols::viewer
• vl_vh_orientation_coords() : protocols::antibody