FloppyTail Namespace Reference

Namespaces
	short_tail

Functions
BooleanOptionKey const	FloppyTail ("FloppyTail")
IntegerOptionKey const	flexible_start_resnum ("FloppyTail:flexible_start_resnum")
IntegerOptionKey const	flexible_stop_resnum ("FloppyTail:flexible_stop_resnum")
StringOptionKey const	flexible_chain ("FloppyTail:flexible_chain")
RealOptionKey const	shear_on ("FloppyTail:shear_on")
BooleanOptionKey const	pair_off ("FloppyTail:pair_off")
BooleanOptionKey const	publication ("FloppyTail:publication")
BooleanOptionKey const	C_root ("FloppyTail:C_root")
BooleanOptionKey const	COM_root ("FloppyTail:COM_root")
BooleanOptionKey const	force_linear_fold_tree ("FloppyTail:force_linear_fold_tree")
BooleanOptionKey const	debug ("FloppyTail:debug")
StringOptionKey const	cen_weights ("FloppyTail:cen_weights")
BooleanOptionKey const	perturb_show ("FloppyTail:perturb_show")
IntegerOptionKey const	perturb_cycles ("FloppyTail:perturb_cycles")
RealOptionKey const	perturb_temp ("FloppyTail:perturb_temp")
IntegerOptionKey const	refine_cycles ("FloppyTail:refine_cycles")
RealOptionKey const	refine_temp ("FloppyTail:refine_temp")
IntegerOptionKey const	refine_repack_cycles ("FloppyTail:refine_repack_cycles")

Function Documentation

C_root()

BooleanOptionKey const FloppyTail::C_root

(

"FloppyTail:C_root"

)

cen_weights()

StringOptionKey const FloppyTail::cen_weights

(

"FloppyTail:cen_weights"

)

COM_root()

BooleanOptionKey const FloppyTail::COM_root

(

"FloppyTail:COM_root"

)

debug()

BooleanOptionKey const FloppyTail::debug

(

"FloppyTail:debug"

)

flexible_chain()

StringOptionKey const FloppyTail::flexible_chain

(

"FloppyTail:flexible_chain"

)

flexible_start_resnum()

IntegerOptionKey const FloppyTail::flexible_start_resnum

(

"FloppyTail:flexible_start_resnum"

)

flexible_stop_resnum()

IntegerOptionKey const FloppyTail::flexible_stop_resnum

(

"FloppyTail:flexible_stop_resnum"

)

FloppyTail()

BooleanOptionKey const FloppyTail::FloppyTail

(

"FloppyTail"

)

force_linear_fold_tree()

BooleanOptionKey const FloppyTail::force_linear_fold_tree

(

"FloppyTail:force_linear_fold_tree"

)

pair_off()

BooleanOptionKey const FloppyTail::pair_off

(

"FloppyTail:pair_off"

)

perturb_cycles()

IntegerOptionKey const FloppyTail::perturb_cycles

(

"FloppyTail:perturb_cycles"

)

perturb_show()

BooleanOptionKey const FloppyTail::perturb_show

(

"FloppyTail:perturb_show"

)

perturb_temp()

RealOptionKey const FloppyTail::perturb_temp

(

"FloppyTail:perturb_temp"

)

publication()

BooleanOptionKey const FloppyTail::publication

(

"FloppyTail:publication"

)

refine_cycles()

IntegerOptionKey const FloppyTail::refine_cycles

(

"FloppyTail:refine_cycles"

)

refine_repack_cycles()

IntegerOptionKey const FloppyTail::refine_repack_cycles

(

"FloppyTail:refine_repack_cycles"

)

refine_temp()

RealOptionKey const FloppyTail::refine_temp

(

"FloppyTail:refine_temp"

)

shear_on()

RealOptionKey const FloppyTail::shear_on

(

"FloppyTail:shear_on"

)