rna::denovo::out Namespace Reference

Functions
BooleanOptionKey const	out ("rna:denovo:out")
BooleanOptionKey const	output_lores_silent_file ("rna:denovo:out:output_lores_silent_file")
BooleanOptionKey const	dump ("rna:denovo:out:dump")
BooleanOptionKey const	binary_output ("rna:denovo:out:binary_output")
StringOptionKey const	output_score_file ("rna:denovo:out:output_score_file")
IntegerOptionKey const	output_score_frequency ("rna:denovo:out:output_score_frequency")
ResidueChainVectorOptionKey const	output_jump_res ("rna:denovo:out:output_jump_res")
BooleanOptionKey const	output_jump_o3p_to_o5p ("rna:denovo:out:output_jump_o3p_to_o5p")
BooleanOptionKey const	output_jump_chainbreak ("rna:denovo:out:output_jump_chainbreak")
BooleanOptionKey const	output_rotation_vector ("rna:denovo:out:output_rotation_vector")
StringOptionKey const	output_jump_reference_RT ("rna:denovo:out:output_jump_reference_RT")
RealVectorOptionKey const	target_xyz ("rna:denovo:out:target_xyz")
BooleanOptionKey const	save_jump_histogram ("rna:denovo:out:save_jump_histogram")
StringOptionKey const	output_histogram_file ("rna:denovo:out:output_histogram_file")
RealOptionKey const	jump_histogram_boxsize ("rna:denovo:out:jump_histogram_boxsize")
RealOptionKey const	jump_histogram_binwidth ("rna:denovo:out:jump_histogram_binwidth")
RealOptionKey const	jump_histogram_binwidth_rotvector ("rna:denovo:out:jump_histogram_binwidth_rotvector")

Function Documentation

binary_output()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::binary_output

(

"rna:denovo:out:binary_output"

)

References rna::denovo::denovo().

dump()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::dump

(

"rna:denovo:out:dump"

)

References rna::denovo::denovo().

jump_histogram_binwidth()

RealOptionKey const rna::denovo::out::jump_histogram_binwidth

(

"rna:denovo:out:jump_histogram_binwidth"

)

References rna::denovo::denovo().

jump_histogram_binwidth_rotvector()

RealOptionKey const rna::denovo::out::jump_histogram_binwidth_rotvector

(

"rna:denovo:out:jump_histogram_binwidth_rotvector"

)

References rna::denovo::denovo().

jump_histogram_boxsize()

RealOptionKey const rna::denovo::out::jump_histogram_boxsize

(

"rna:denovo:out:jump_histogram_boxsize"

)

References rna::denovo::denovo().

out()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::out

(

"rna:denovo:out"

)

References rna::denovo::denovo().

output_histogram_file()

StringOptionKey const rna::denovo::out::output_histogram_file

(

"rna:denovo:out:output_histogram_file"

)

References rna::denovo::denovo().

output_jump_chainbreak()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::output_jump_chainbreak

(

"rna:denovo:out:output_jump_chainbreak"

)

References rna::denovo::denovo().

output_jump_o3p_to_o5p()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::output_jump_o3p_to_o5p

(

"rna:denovo:out:output_jump_o3p_to_o5p"

)

References rna::denovo::denovo().

output_jump_reference_RT()

StringOptionKey const rna::denovo::out::output_jump_reference_RT

(

"rna:denovo:out:output_jump_reference_RT"

)

References rna::denovo::denovo().

output_jump_res()

ResidueChainVectorOptionKey const rna::denovo::out::output_jump_res

(

"rna:denovo:out:output_jump_res"

)

References rna::denovo::denovo().

output_lores_silent_file()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::output_lores_silent_file

(

"rna:denovo:out:output_lores_silent_file"

)

References rna::denovo::denovo().

output_rotation_vector()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::output_rotation_vector

(

"rna:denovo:out:output_rotation_vector"

)

References rna::denovo::denovo().

output_score_file()

StringOptionKey const rna::denovo::out::output_score_file

(

"rna:denovo:out:output_score_file"

)

References rna::denovo::denovo().

output_score_frequency()

IntegerOptionKey const rna::denovo::out::output_score_frequency

(

"rna:denovo:out:output_score_frequency"

)

References rna::denovo::denovo().

save_jump_histogram()

BooleanOptionKey const rna::denovo::out::save_jump_histogram

(

"rna:denovo:out:save_jump_histogram"

)

References rna::denovo::denovo().

target_xyz()

RealVectorOptionKey const rna::denovo::out::target_xyz

(

"rna:denovo:out:target_xyz"

)

References rna::denovo::denovo().