load_pair_env_table.m File Reference

Functions
	pair (1, 1,:)
	pair (1, 2,:)
	pair (1, 3,:)
	pair (1, 4,:)
	pair (1, 5,:)
	pair (1, 6,:)
	pair (1, 7,:)
	pair (1, 8,:)
	pair (1, 9,:)
	pair (1, 10,:)
	pair (1, 11,:)
	pair (1, 12,:)
	pair (1, 13,:)
	pair (1, 14,:)
	pair (1, 15,:)
	pair (1, 16,:)
	pair (1, 17,:)
	pair (1, 18,:)
	pair (1, 19,:)
	pair (1, 20,:)
	pair (2, 1,:)
	pair (2, 2,:)
	pair (2, 3,:)
	pair (2, 4,:)
	pair (2, 5,:)
	pair (2, 6,:)
	pair (2, 7,:)
	pair (2, 8,:)
	pair (2, 9,:)
	pair (2, 10,:)
	pair (2, 11,:)
	pair (2, 12,:)
	pair (2, 13,:)
	pair (2, 14,:)
	pair (2, 15,:)
	pair (2, 16,:)
	pair (2, 17,:)
	pair (2, 18,:)
	pair (2, 19,:)
	pair (2, 20,:)
	pair (3, 1,:)
	pair (3, 2,:)
	pair (3, 3,:)
	pair (3, 4,:)
	pair (3, 5,:)
	pair (3, 6,:)
	pair (3, 7,:)
	pair (3, 8,:)
	pair (3, 9,:)
	pair (3, 10,:)
	pair (3, 11,:)
	pair (3, 12,:)
	pair (3, 13,:)
	pair (3, 14,:)
	pair (3, 15,:)
	pair (3, 16,:)
	pair (3, 17,:)
	pair (3, 18,:)
	pair (3, 19,:)
	pair (3, 20,:)
	pair (4, 1,:)
	pair (4, 2,:)
	pair (4, 3,:)
	pair (4, 4,:)
	pair (4, 5,:)
	pair (4, 6,:)
	pair (4, 7,:)
	pair (4, 8,:)
	pair (4, 9,:)
	pair (4, 10,:)
	pair (4, 11,:)
	pair (4, 12,:)
	pair (4, 13,:)
	pair (4, 14,:)
	pair (4, 15,:)
	pair (4, 16,:)
	pair (4, 17,:)
	pair (4, 18,:)
	pair (4, 19,:)
	pair (4, 20,:)
	pair (5, 1,:)
	pair (5, 2,:)
	pair (5, 3,:)
	pair (5, 4,:)
	pair (5, 5,:)
	pair (5, 6,:)
	pair (5, 7,:)
	pair (5, 8,:)
	pair (5, 9,:)
	pair (5, 10,:)
	pair (5, 11,:)
	pair (5, 12,:)
	pair (5, 13,:)
	pair (5, 14,:)
	pair (5, 15,:)
	pair (5, 16,:)
	pair (5, 17,:)
	pair (5, 18,:)
	pair (5, 19,:)
	pair (5, 20,:)
	pair (6, 1,:)
	pair (6, 2,:)
	pair (6, 3,:)
	pair (6, 4,:)
	pair (6, 5,:)
	pair (6, 6,:)
	pair (6, 7,:)
	pair (6, 8,:)
	pair (6, 9,:)
	pair (6, 10,:)
	pair (6, 11,:)
	pair (6, 12,:)
	pair (6, 13,:)
	pair (6, 14,:)
	pair (6, 15,:)
	pair (6, 16,:)
	pair (6, 17,:)
	pair (6, 18,:)
	pair (6, 19,:)
	pair (6, 20,:)
	pair (7, 1,:)
	pair (7, 2,:)
	pair (7, 3,:)
	pair (7, 4,:)
	pair (7, 5,:)
	pair (7, 6,:)
	pair (7, 7,:)
	pair (7, 8,:)
	pair (7, 9,:)
	pair (7, 10,:)
	pair (7, 11,:)
	pair (7, 12,:)
	pair (7, 13,:)
	pair (7, 14,:)
	pair (7, 15,:)
	pair (7, 16,:)
	pair (7, 17,:)
	pair (7, 18,:)
	pair (7, 19,:)
	pair (7, 20,:)
	pair (8, 1,:)
	pair (8, 2,:)
	pair (8, 3,:)
	pair (8, 4,:)
	pair (8, 5,:)
	pair (8, 6,:)
	pair (8, 7,:)
	pair (8, 8,:)
	pair (8, 9,:)
	pair (8, 10,:)
	pair (8, 11,:)
	pair (8, 12,:)
	pair (8, 13,:)
	pair (8, 14,:)
	pair (8, 15,:)
	pair (8, 16,:)
	pair (8, 17,:)
	pair (8, 18,:)
	pair (8, 19,:)
	pair (8, 20,:)
	pair (9, 1,:)
	pair (9, 2,:)
	pair (9, 3,:)
	pair (9, 4,:)
	pair (9, 5,:)
	pair (9, 6,:)
	pair (9, 7,:)
	pair (9, 8,:)
	pair (9, 9,:)
	pair (9, 10,:)
	pair (9, 11,:)
	pair (9, 12,:)
	pair (9, 13,:)
	pair (9, 14,:)
	pair (9, 15,:)
	pair (9, 16,:)
	pair (9, 17,:)
	pair (9, 18,:)
	pair (9, 19,:)
	pair (9, 20,:)
	pair (10, 1,:)
	pair (10, 2,:)
	pair (10, 3,:)
	pair (10, 4,:)
	pair (10, 5,:)
	pair (10, 6,:)
	pair (10, 7,:)
	pair (10, 8,:)
	pair (10, 9,:)
	pair (10, 10,:)
	pair (10, 11,:)
	pair (10, 12,:)
	pair (10, 13,:)
	pair (10, 14,:)
	pair (10, 15,:)
	pair (10, 16,:)
	pair (10, 17,:)
	pair (10, 18,:)
	pair (10, 19,:)
	pair (10, 20,:)
	pair (11, 1,:)
	pair (11, 2,:)
	pair (11, 3,:)
	pair (11, 4,:)
	pair (11, 5,:)
	pair (11, 6,:)
	pair (11, 7,:)
	pair (11, 8,:)
	pair (11, 9,:)
	pair (11, 10,:)
	pair (11, 11,:)
	pair (11, 12,:)
	pair (11, 13,:)
	pair (11, 14,:)
	pair (11, 15,:)
	pair (11, 16,:)
	pair (11, 17,:)
	pair (11, 18,:)
	pair (11, 19,:)
	pair (11, 20,:)
	pair (12, 1,:)
	pair (12, 2,:)
	pair (12, 3,:)
	pair (12, 4,:)
	pair (12, 5,:)
	pair (12, 6,:)
	pair (12, 7,:)
	pair (12, 8,:)
	pair (12, 9,:)
	pair (12, 10,:)
	pair (12, 11,:)
	pair (12, 12,:)
	pair (12, 13,:)
	pair (12, 14,:)
	pair (12, 15,:)
	pair (12, 16,:)
	pair (12, 17,:)
	pair (12, 18,:)
	pair (12, 19,:)
	pair (12, 20,:)
	pair (13, 1,:)
	pair (13, 2,:)
	pair (13, 3,:)
	pair (13, 4,:)
	pair (13, 5,:)
	pair (13, 6,:)
	pair (13, 7,:)
	pair (13, 8,:)
	pair (13, 9,:)
	pair (13, 10,:)
	pair (13, 11,:)
	pair (13, 12,:)
	pair (13, 13,:)
	pair (13, 14,:)
	pair (13, 15,:)
	pair (13, 16,:)
	pair (13, 17,:)
	pair (13, 18,:)
	pair (13, 19,:)
	pair (13, 20,:)
	pair (14, 1,:)
	pair (14, 2,:)
	pair (14, 3,:)
	pair (14, 4,:)
	pair (14, 5,:)
	pair (14, 6,:)
	pair (14, 7,:)
	pair (14, 8,:)
	pair (14, 9,:)
	pair (14, 10,:)
	pair (14, 11,:)
	pair (14, 12,:)
	pair (14, 13,:)
	pair (14, 14,:)
	pair (14, 15,:)
	pair (14, 16,:)
	pair (14, 17,:)
	pair (14, 18,:)
	pair (14, 19,:)
	pair (14, 20,:)
	pair (15, 1,:)
	pair (15, 2,:)
	pair (15, 3,:)
	pair (15, 4,:)
	pair (15, 5,:)
	pair (15, 6,:)
	pair (15, 7,:)
	pair (15, 8,:)
	pair (15, 9,:)
	pair (15, 10,:)
	pair (15, 11,:)
	pair (15, 12,:)
	pair (15, 13,:)
	pair (15, 14,:)
	pair (15, 15,:)
	pair (15, 16,:)
	pair (15, 17,:)
	pair (15, 18,:)
	pair (15, 19,:)
	pair (15, 20,:)
	pair (16, 1,:)
	pair (16, 2,:)
	pair (16, 3,:)
	pair (16, 4,:)
	pair (16, 5,:)
	pair (16, 6,:)
	pair (16, 7,:)
	pair (16, 8,:)
	pair (16, 9,:)
	pair (16, 10,:)
	pair (16, 11,:)
	pair (16, 12,:)
	pair (16, 13,:)
	pair (16, 14,:)
	pair (16, 15,:)
	pair (16, 16,:)
	pair (16, 17,:)
	pair (16, 18,:)
	pair (16, 19,:)
	pair (16, 20,:)
	pair (17, 1,:)
	pair (17, 2,:)
	pair (17, 3,:)
	pair (17, 4,:)
	pair (17, 5,:)
	pair (17, 6,:)
	pair (17, 7,:)
	pair (17, 8,:)
	pair (17, 9,:)
	pair (17, 10,:)
	pair (17, 11,:)
	pair (17, 12,:)
	pair (17, 13,:)
	pair (17, 14,:)
	pair (17, 15,:)
	pair (17, 16,:)
	pair (17, 17,:)
	pair (17, 18,:)
	pair (17, 19,:)
	pair (17, 20,:)
	pair (18, 1,:)
	pair (18, 2,:)
	pair (18, 3,:)
	pair (18, 4,:)
	pair (18, 5,:)
	pair (18, 6,:)
	pair (18, 7,:)
	pair (18, 8,:)
	pair (18, 9,:)
	pair (18, 10,:)
	pair (18, 11,:)
	pair (18, 12,:)
	pair (18, 13,:)
	pair (18, 14,:)
	pair (18, 15,:)
	pair (18, 16,:)
	pair (18, 17,:)
	pair (18, 18,:)
	pair (18, 19,:)
	pair (18, 20,:)
	pair (19, 1,:)
	pair (19, 2,:)
	pair (19, 3,:)
	pair (19, 4,:)
	pair (19, 5,:)
	pair (19, 6,:)
	pair (19, 7,:)
	pair (19, 8,:)
	pair (19, 9,:)
	pair (19, 10,:)
	pair (19, 11,:)
	pair (19, 12,:)
	pair (19, 13,:)
	pair (19, 14,:)
	pair (19, 15,:)
	pair (19, 16,:)
	pair (19, 17,:)
	pair (19, 18,:)
	pair (19, 19,:)
	pair (19, 20,:)
	pair (20, 1,:)
	pair (20, 2,:)
	pair (20, 3,:)
	pair (20, 4,:)
	pair (20, 5,:)
	pair (20, 6,:)
	pair (20, 7,:)
	pair (20, 8,:)
	pair (20, 9,:)
	pair (20, 10,:)
	pair (20, 11,:)
	pair (20, 12,:)
	pair (20, 13,:)
	pair (20, 14,:)
	pair (20, 15,:)
	pair (20, 16,:)
	pair (20, 17,:)
	pair (20, 18,:)
	pair (20, 19,:)
	pair (20, 20,:)
	env (1,:)
	env (2,:)
	env (3,:)
	env (4,:)
	env (5,:)
	env (6,:)
	env (7,:)
	env (8,:)
	env (9,:)
	env (10,:)
	env (11,:)
	env (12,:)
	env (13,:)
	env (14,:)
	env (15,:)
	env (16,:)
	env (17,:)
	env (18,:)
	env (19,:)
	env (20,:)

Variables
	function [list, pair, env]
	LYS
	SER
	ILE
	ASN
	CYS
	ASP
	LEU
	GLY
	VAL
	ARG
	PHE
	PRO
	THR
	TYR
	ALA
	MET
	HIS
	GLN
	TRP
	pair = zeros(20,20,30)
	env = zeros(20,40)

Function Documentation

env() [1/20]

env	(	1	,
		:
	)

env() [2/20]

env	(	10	,
		:
	)

env() [3/20]

env	(	11	,
		:
	)

env() [4/20]

env	(	12	,
		:
	)

env() [5/20]

env	(	13	,
		:
	)

env() [6/20]

env	(	14	,
		:
	)

env() [7/20]

env	(	15	,
		:
	)

env() [8/20]

env	(	16	,
		:
	)

env() [9/20]

env	(	17	,
		:
	)

env() [10/20]

env	(	18	,
		:
	)

env() [11/20]

env	(	19	,
		:
	)

env() [12/20]

env	(	2	,
		:
	)

env() [13/20]

env	(	20	,
		:
	)

env() [14/20]

env	(	3	,
		:
	)

env() [15/20]

env	(	4	,
		:
	)

env() [16/20]

env	(	5	,
		:
	)

env() [17/20]

env	(	6	,
		:
	)

env() [18/20]

env	(	7	,
		:
	)

env() [19/20]

env	(	8	,
		:
	)

env() [20/20]

env	(	9	,
		:
	)

pair() [1/400]

pair	(	1	,
		1	,
		:
	)

pair() [2/400]

pair	(	1	,
		10	,
		:
	)

pair() [3/400]

pair	(	1	,
		11	,
		:
	)

pair() [4/400]

pair	(	1	,
		12	,
		:
	)

pair() [5/400]

pair	(	1	,
		13	,
		:
	)

pair() [6/400]

pair	(	1	,
		14	,
		:
	)

pair() [7/400]

pair	(	1	,
		15	,
		:
	)

pair() [8/400]

pair	(	1	,
		16	,
		:
	)

pair() [9/400]

pair	(	1	,
		17	,
		:
	)

pair() [10/400]

pair	(	1	,
		18	,
		:
	)

pair() [11/400]

pair	(	1	,
		19	,
		:
	)

pair() [12/400]

pair	(	1	,
		2	,
		:
	)

pair() [13/400]

pair	(	1	,
		20	,
		:
	)

pair() [14/400]

pair	(	1	,
		3	,
		:
	)

pair() [15/400]

pair	(	1	,
		4	,
		:
	)

pair() [16/400]

pair	(	1	,
		5	,
		:
	)

pair() [17/400]

pair	(	1	,
		6	,
		:
	)

pair() [18/400]

pair	(	1	,
		7	,
		:
	)

pair() [19/400]

pair	(	1	,
		8	,
		:
	)

pair() [20/400]

pair	(	1	,
		9	,
		:
	)

pair() [21/400]

pair	(	10	,
		1	,
		:
	)

pair() [22/400]

pair	(	10	,
		10	,
		:
	)

pair() [23/400]

pair	(	10	,
		11	,
		:
	)

pair() [24/400]

pair	(	10	,
		12	,
		:
	)

pair() [25/400]

pair	(	10	,
		13	,
		:
	)

pair() [26/400]

pair	(	10	,
		14	,
		:
	)

pair() [27/400]

pair	(	10	,
		15	,
		:
	)

pair() [28/400]

pair	(	10	,
		16	,
		:
	)

pair() [29/400]

pair	(	10	,
		17	,
		:
	)

pair() [30/400]

pair	(	10	,
		18	,
		:
	)

pair() [31/400]

pair	(	10	,
		19	,
		:
	)

pair() [32/400]

pair	(	10	,
		2	,
		:
	)

pair() [33/400]

pair	(	10	,
		20	,
		:
	)

pair() [34/400]

pair	(	10	,
		3	,
		:
	)

pair() [35/400]

pair	(	10	,
		4	,
		:
	)

pair() [36/400]

pair	(	10	,
		5	,
		:
	)

pair() [37/400]

pair	(	10	,
		6	,
		:
	)

pair() [38/400]

pair	(	10	,
		7	,
		:
	)

pair() [39/400]

pair	(	10	,
		8	,
		:
	)

pair() [40/400]

pair	(	10	,
		9	,
		:
	)

pair() [41/400]

pair	(	11	,
		1	,
		:
	)

pair() [42/400]

pair	(	11	,
		10	,
		:
	)

pair() [43/400]

pair	(	11	,
		11	,
		:
	)

pair() [44/400]

pair	(	11	,
		12	,
		:
	)

pair() [45/400]

pair	(	11	,
		13	,
		:
	)

pair() [46/400]

pair	(	11	,
		14	,
		:
	)

pair() [47/400]

pair	(	11	,
		15	,
		:
	)

pair() [48/400]

pair	(	11	,
		16	,
		:
	)

pair() [49/400]

pair	(	11	,
		17	,
		:
	)

pair() [50/400]

pair	(	11	,
		18	,
		:
	)

pair() [51/400]

pair	(	11	,
		19	,
		:
	)

pair() [52/400]

pair	(	11	,
		2	,
		:
	)

pair() [53/400]

pair	(	11	,
		20	,
		:
	)

pair() [54/400]

pair	(	11	,
		3	,
		:
	)

pair() [55/400]

pair	(	11	,
		4	,
		:
	)

pair() [56/400]

pair	(	11	,
		5	,
		:
	)

pair() [57/400]

pair	(	11	,
		6	,
		:
	)

pair() [58/400]

pair	(	11	,
		7	,
		:
	)

pair() [59/400]

pair	(	11	,
		8	,
		:
	)

pair() [60/400]

pair	(	11	,
		9	,
		:
	)

pair() [61/400]

pair	(	12	,
		1	,
		:
	)

pair() [62/400]

pair	(	12	,
		10	,
		:
	)

pair() [63/400]

pair	(	12	,
		11	,
		:
	)

pair() [64/400]

pair	(	12	,
		12	,
		:
	)

pair() [65/400]

pair	(	12	,
		13	,
		:
	)

pair() [66/400]

pair	(	12	,
		14	,
		:
	)

pair() [67/400]

pair	(	12	,
		15	,
		:
	)

pair() [68/400]

pair	(	12	,
		16	,
		:
	)

pair() [69/400]

pair	(	12	,
		17	,
		:
	)

pair() [70/400]

pair	(	12	,
		18	,
		:
	)

pair() [71/400]

pair	(	12	,
		19	,
		:
	)

pair() [72/400]

pair	(	12	,
		2	,
		:
	)

pair() [73/400]

pair	(	12	,
		20	,
		:
	)

pair() [74/400]

pair	(	12	,
		3	,
		:
	)

pair() [75/400]

pair	(	12	,
		4	,
		:
	)

pair() [76/400]

pair	(	12	,
		5	,
		:
	)

pair() [77/400]

pair	(	12	,
		6	,
		:
	)

pair() [78/400]

pair	(	12	,
		7	,
		:
	)

pair() [79/400]

pair	(	12	,
		8	,
		:
	)

pair() [80/400]

pair	(	12	,
		9	,
		:
	)

pair() [81/400]

pair	(	13	,
		1	,
		:
	)

pair() [82/400]

pair	(	13	,
		10	,
		:
	)

pair() [83/400]

pair	(	13	,
		11	,
		:
	)

pair() [84/400]

pair	(	13	,
		12	,
		:
	)

pair() [85/400]

pair	(	13	,
		13	,
		:
	)

pair() [86/400]

pair	(	13	,
		14	,
		:
	)

pair() [87/400]

pair	(	13	,
		15	,
		:
	)

pair() [88/400]

pair	(	13	,
		16	,
		:
	)

pair() [89/400]

pair	(	13	,
		17	,
		:
	)

pair() [90/400]

pair	(	13	,
		18	,
		:
	)

pair() [91/400]

pair	(	13	,
		19	,
		:
	)

pair() [92/400]

pair	(	13	,
		2	,
		:
	)

pair() [93/400]

pair	(	13	,
		20	,
		:
	)

pair() [94/400]

pair	(	13	,
		3	,
		:
	)

pair() [95/400]

pair	(	13	,
		4	,
		:
	)

pair() [96/400]

pair	(	13	,
		5	,
		:
	)

pair() [97/400]

pair	(	13	,
		6	,
		:
	)

pair() [98/400]

pair	(	13	,
		7	,
		:
	)

pair() [99/400]

pair	(	13	,
		8	,
		:
	)

pair() [100/400]

pair	(	13	,
		9	,
		:
	)

pair() [101/400]

pair	(	14	,
		1	,
		:
	)

pair() [102/400]

pair	(	14	,
		10	,
		:
	)

pair() [103/400]

pair	(	14	,
		11	,
		:
	)

pair() [104/400]

pair	(	14	,
		12	,
		:
	)

pair() [105/400]

pair	(	14	,
		13	,
		:
	)

pair() [106/400]

pair	(	14	,
		14	,
		:
	)

pair() [107/400]

pair	(	14	,
		15	,
		:
	)

pair() [108/400]

pair	(	14	,
		16	,
		:
	)

pair() [109/400]

pair	(	14	,
		17	,
		:
	)

pair() [110/400]

pair	(	14	,
		18	,
		:
	)

pair() [111/400]

pair	(	14	,
		19	,
		:
	)

pair() [112/400]

pair	(	14	,
		2	,
		:
	)

pair() [113/400]

pair	(	14	,
		20	,
		:
	)

pair() [114/400]

pair	(	14	,
		3	,
		:
	)

pair() [115/400]

pair	(	14	,
		4	,
		:
	)

pair() [116/400]

pair	(	14	,
		5	,
		:
	)

pair() [117/400]

pair	(	14	,
		6	,
		:
	)

pair() [118/400]

pair	(	14	,
		7	,
		:
	)

pair() [119/400]

pair	(	14	,
		8	,
		:
	)

pair() [120/400]

pair	(	14	,
		9	,
		:
	)

pair() [121/400]

pair	(	15	,
		1	,
		:
	)

pair() [122/400]

pair	(	15	,
		10	,
		:
	)

pair() [123/400]

pair	(	15	,
		11	,
		:
	)

pair() [124/400]

pair	(	15	,
		12	,
		:
	)

pair() [125/400]

pair	(	15	,
		13	,
		:
	)

pair() [126/400]

pair	(	15	,
		14	,
		:
	)

pair() [127/400]

pair	(	15	,
		15	,
		:
	)

pair() [128/400]

pair	(	15	,
		16	,
		:
	)

pair() [129/400]

pair	(	15	,
		17	,
		:
	)

pair() [130/400]

pair	(	15	,
		18	,
		:
	)

pair() [131/400]

pair	(	15	,
		19	,
		:
	)

pair() [132/400]

pair	(	15	,
		2	,
		:
	)

pair() [133/400]

pair	(	15	,
		20	,
		:
	)

pair() [134/400]

pair	(	15	,
		3	,
		:
	)

pair() [135/400]

pair	(	15	,
		4	,
		:
	)

pair() [136/400]

pair	(	15	,
		5	,
		:
	)

pair() [137/400]

pair	(	15	,
		6	,
		:
	)

pair() [138/400]

pair	(	15	,
		7	,
		:
	)

pair() [139/400]

pair	(	15	,
		8	,
		:
	)

pair() [140/400]

pair	(	15	,
		9	,
		:
	)

pair() [141/400]

pair	(	16	,
		1	,
		:
	)

pair() [142/400]

pair	(	16	,
		10	,
		:
	)

pair() [143/400]

pair	(	16	,
		11	,
		:
	)

pair() [144/400]

pair	(	16	,
		12	,
		:
	)

pair() [145/400]

pair	(	16	,
		13	,
		:
	)

pair() [146/400]

pair	(	16	,
		14	,
		:
	)

pair() [147/400]

pair	(	16	,
		15	,
		:
	)

pair() [148/400]

pair	(	16	,
		16	,
		:
	)

pair() [149/400]

pair	(	16	,
		17	,
		:
	)

pair() [150/400]

pair	(	16	,
		18	,
		:
	)

pair() [151/400]

pair	(	16	,
		19	,
		:
	)

pair() [152/400]

pair	(	16	,
		2	,
		:
	)

pair() [153/400]

pair	(	16	,
		20	,
		:
	)

pair() [154/400]

pair	(	16	,
		3	,
		:
	)

pair() [155/400]

pair	(	16	,
		4	,
		:
	)

pair() [156/400]

pair	(	16	,
		5	,
		:
	)

pair() [157/400]

pair	(	16	,
		6	,
		:
	)

pair() [158/400]

pair	(	16	,
		7	,
		:
	)

pair() [159/400]

pair	(	16	,
		8	,
		:
	)

pair() [160/400]

pair	(	16	,
		9	,
		:
	)

pair() [161/400]

pair	(	17	,
		1	,
		:
	)

pair() [162/400]

pair	(	17	,
		10	,
		:
	)

pair() [163/400]

pair	(	17	,
		11	,
		:
	)

pair() [164/400]

pair	(	17	,
		12	,
		:
	)

pair() [165/400]

pair	(	17	,
		13	,
		:
	)

pair() [166/400]

pair	(	17	,
		14	,
		:
	)

pair() [167/400]

pair	(	17	,
		15	,
		:
	)

pair() [168/400]

pair	(	17	,
		16	,
		:
	)

pair() [169/400]

pair	(	17	,
		17	,
		:
	)

pair() [170/400]

pair	(	17	,
		18	,
		:
	)

pair() [171/400]

pair	(	17	,
		19	,
		:
	)

pair() [172/400]

pair	(	17	,
		2	,
		:
	)

pair() [173/400]

pair	(	17	,
		20	,
		:
	)

pair() [174/400]

pair	(	17	,
		3	,
		:
	)

pair() [175/400]

pair	(	17	,
		4	,
		:
	)

pair() [176/400]

pair	(	17	,
		5	,
		:
	)

pair() [177/400]

pair	(	17	,
		6	,
		:
	)

pair() [178/400]

pair	(	17	,
		7	,
		:
	)

pair() [179/400]

pair	(	17	,
		8	,
		:
	)

pair() [180/400]

pair	(	17	,
		9	,
		:
	)

pair() [181/400]

pair	(	18	,
		1	,
		:
	)

pair() [182/400]

pair	(	18	,
		10	,
		:
	)

pair() [183/400]

pair	(	18	,
		11	,
		:
	)

pair() [184/400]

pair	(	18	,
		12	,
		:
	)

pair() [185/400]

pair	(	18	,
		13	,
		:
	)

pair() [186/400]

pair	(	18	,
		14	,
		:
	)

pair() [187/400]

pair	(	18	,
		15	,
		:
	)

pair() [188/400]

pair	(	18	,
		16	,
		:
	)

pair() [189/400]

pair	(	18	,
		17	,
		:
	)

pair() [190/400]

pair	(	18	,
		18	,
		:
	)

pair() [191/400]

pair	(	18	,
		19	,
		:
	)

pair() [192/400]

pair	(	18	,
		2	,
		:
	)

pair() [193/400]

pair	(	18	,
		20	,
		:
	)

pair() [194/400]

pair	(	18	,
		3	,
		:
	)

pair() [195/400]

pair	(	18	,
		4	,
		:
	)

pair() [196/400]

pair	(	18	,
		5	,
		:
	)

pair() [197/400]

pair	(	18	,
		6	,
		:
	)

pair() [198/400]

pair	(	18	,
		7	,
		:
	)

pair() [199/400]

pair	(	18	,
		8	,
		:
	)

pair() [200/400]

pair	(	18	,
		9	,
		:
	)

pair() [201/400]

pair	(	19	,
		1	,
		:
	)

pair() [202/400]

pair	(	19	,
		10	,
		:
	)

pair() [203/400]

pair	(	19	,
		11	,
		:
	)

pair() [204/400]

pair	(	19	,
		12	,
		:
	)

pair() [205/400]

pair	(	19	,
		13	,
		:
	)

pair() [206/400]

pair	(	19	,
		14	,
		:
	)

pair() [207/400]

pair	(	19	,
		15	,
		:
	)

pair() [208/400]

pair	(	19	,
		16	,
		:
	)

pair() [209/400]

pair	(	19	,
		17	,
		:
	)

pair() [210/400]

pair	(	19	,
		18	,
		:
	)

pair() [211/400]

pair	(	19	,
		19	,
		:
	)

pair() [212/400]

pair	(	19	,
		2	,
		:
	)

pair() [213/400]

pair	(	19	,
		20	,
		:
	)

pair() [214/400]

pair	(	19	,
		3	,
		:
	)

pair() [215/400]

pair	(	19	,
		4	,
		:
	)

pair() [216/400]

pair	(	19	,
		5	,
		:
	)

pair() [217/400]

pair	(	19	,
		6	,
		:
	)

pair() [218/400]

pair	(	19	,
		7	,
		:
	)

pair() [219/400]

pair	(	19	,
		8	,
		:
	)

pair() [220/400]

pair	(	19	,
		9	,
		:
	)

pair() [221/400]

pair	(	2	,
		1	,
		:
	)

pair() [222/400]

pair	(	2	,
		10	,
		:
	)

pair() [223/400]

pair	(	2	,
		11	,
		:
	)

pair() [224/400]

pair	(	2	,
		12	,
		:
	)

pair() [225/400]

pair	(	2	,
		13	,
		:
	)

pair() [226/400]

pair	(	2	,
		14	,
		:
	)

pair() [227/400]

pair	(	2	,
		15	,
		:
	)

pair() [228/400]

pair	(	2	,
		16	,
		:
	)

pair() [229/400]

pair	(	2	,
		17	,
		:
	)

pair() [230/400]

pair	(	2	,
		18	,
		:
	)

pair() [231/400]

pair	(	2	,
		19	,
		:
	)

pair() [232/400]

pair	(	2	,
		2	,
		:
	)

pair() [233/400]

pair	(	2	,
		20	,
		:
	)

pair() [234/400]

pair	(	2	,
		3	,
		:
	)

pair() [235/400]

pair	(	2	,
		4	,
		:
	)

pair() [236/400]

pair	(	2	,
		5	,
		:
	)

pair() [237/400]

pair	(	2	,
		6	,
		:
	)

pair() [238/400]

pair	(	2	,
		7	,
		:
	)

pair() [239/400]

pair	(	2	,
		8	,
		:
	)

pair() [240/400]

pair	(	2	,
		9	,
		:
	)

pair() [241/400]

pair	(	20	,
		1	,
		:
	)

pair() [242/400]

pair	(	20	,
		10	,
		:
	)

pair() [243/400]

pair	(	20	,
		11	,
		:
	)

pair() [244/400]

pair	(	20	,
		12	,
		:
	)

pair() [245/400]

pair	(	20	,
		13	,
		:
	)

pair() [246/400]

pair	(	20	,
		14	,
		:
	)

pair() [247/400]

pair	(	20	,
		15	,
		:
	)

pair() [248/400]

pair	(	20	,
		16	,
		:
	)

pair() [249/400]

pair	(	20	,
		17	,
		:
	)

pair() [250/400]

pair	(	20	,
		18	,
		:
	)

pair() [251/400]

pair	(	20	,
		19	,
		:
	)

pair() [252/400]

pair	(	20	,
		2	,
		:
	)

pair() [253/400]

pair	(	20	,
		20	,
		:
	)

pair() [254/400]

pair	(	20	,
		3	,
		:
	)

pair() [255/400]

pair	(	20	,
		4	,
		:
	)

pair() [256/400]

pair	(	20	,
		5	,
		:
	)

pair() [257/400]

pair	(	20	,
		6	,
		:
	)

pair() [258/400]

pair	(	20	,
		7	,
		:
	)

pair() [259/400]

pair	(	20	,
		8	,
		:
	)

pair() [260/400]

pair	(	20	,
		9	,
		:
	)

pair() [261/400]

pair	(	3	,
		1	,
		:
	)

pair() [262/400]

pair	(	3	,
		10	,
		:
	)

pair() [263/400]

pair	(	3	,
		11	,
		:
	)

pair() [264/400]

pair	(	3	,
		12	,
		:
	)

pair() [265/400]

pair	(	3	,
		13	,
		:
	)

pair() [266/400]

pair	(	3	,
		14	,
		:
	)

pair() [267/400]

pair	(	3	,
		15	,
		:
	)

pair() [268/400]

pair	(	3	,
		16	,
		:
	)

pair() [269/400]

pair	(	3	,
		17	,
		:
	)

pair() [270/400]

pair	(	3	,
		18	,
		:
	)

pair() [271/400]

pair	(	3	,
		19	,
		:
	)

pair() [272/400]

pair	(	3	,
		2	,
		:
	)

pair() [273/400]

pair	(	3	,
		20	,
		:
	)

pair() [274/400]

pair	(	3	,
		3	,
		:
	)

pair() [275/400]

pair	(	3	,
		4	,
		:
	)

pair() [276/400]

pair	(	3	,
		5	,
		:
	)

pair() [277/400]

pair	(	3	,
		6	,
		:
	)

pair() [278/400]

pair	(	3	,
		7	,
		:
	)

pair() [279/400]

pair	(	3	,
		8	,
		:
	)

pair() [280/400]

pair	(	3	,
		9	,
		:
	)

pair() [281/400]

pair	(	4	,
		1	,
		:
	)

pair() [282/400]

pair	(	4	,
		10	,
		:
	)

pair() [283/400]

pair	(	4	,
		11	,
		:
	)

pair() [284/400]

pair	(	4	,
		12	,
		:
	)

pair() [285/400]

pair	(	4	,
		13	,
		:
	)

pair() [286/400]

pair	(	4	,
		14	,
		:
	)

pair() [287/400]

pair	(	4	,
		15	,
		:
	)

pair() [288/400]

pair	(	4	,
		16	,
		:
	)

pair() [289/400]

pair	(	4	,
		17	,
		:
	)

pair() [290/400]

pair	(	4	,
		18	,
		:
	)

pair() [291/400]

pair	(	4	,
		19	,
		:
	)

pair() [292/400]

pair	(	4	,
		2	,
		:
	)

pair() [293/400]

pair	(	4	,
		20	,
		:
	)

pair() [294/400]

pair	(	4	,
		3	,
		:
	)

pair() [295/400]

pair	(	4	,
		4	,
		:
	)

pair() [296/400]

pair	(	4	,
		5	,
		:
	)

pair() [297/400]

pair	(	4	,
		6	,
		:
	)

pair() [298/400]

pair	(	4	,
		7	,
		:
	)

pair() [299/400]

pair	(	4	,
		8	,
		:
	)

pair() [300/400]

pair	(	4	,
		9	,
		:
	)

pair() [301/400]

pair	(	5	,
		1	,
		:
	)

pair() [302/400]

pair	(	5	,
		10	,
		:
	)

pair() [303/400]

pair	(	5	,
		11	,
		:
	)

pair() [304/400]

pair	(	5	,
		12	,
		:
	)

pair() [305/400]

pair	(	5	,
		13	,
		:
	)

pair() [306/400]

pair	(	5	,
		14	,
		:
	)

pair() [307/400]

pair	(	5	,
		15	,
		:
	)

pair() [308/400]

pair	(	5	,
		16	,
		:
	)

pair() [309/400]

pair	(	5	,
		17	,
		:
	)

pair() [310/400]

pair	(	5	,
		18	,
		:
	)

pair() [311/400]

pair	(	5	,
		19	,
		:
	)

pair() [312/400]

pair	(	5	,
		2	,
		:
	)

pair() [313/400]

pair	(	5	,
		20	,
		:
	)

pair() [314/400]

pair	(	5	,
		3	,
		:
	)

pair() [315/400]

pair	(	5	,
		4	,
		:
	)

pair() [316/400]

pair	(	5	,
		5	,
		:
	)

pair() [317/400]

pair	(	5	,
		6	,
		:
	)

pair() [318/400]

pair	(	5	,
		7	,
		:
	)

pair() [319/400]

pair	(	5	,
		8	,
		:
	)

pair() [320/400]

pair	(	5	,
		9	,
		:
	)

pair() [321/400]

pair	(	6	,
		1	,
		:
	)

pair() [322/400]

pair	(	6	,
		10	,
		:
	)

pair() [323/400]

pair	(	6	,
		11	,
		:
	)

pair() [324/400]

pair	(	6	,
		12	,
		:
	)

pair() [325/400]

pair	(	6	,
		13	,
		:
	)

pair() [326/400]

pair	(	6	,
		14	,
		:
	)

pair() [327/400]

pair	(	6	,
		15	,
		:
	)

pair() [328/400]

pair	(	6	,
		16	,
		:
	)

pair() [329/400]

pair	(	6	,
		17	,
		:
	)

pair() [330/400]

pair	(	6	,
		18	,
		:
	)

pair() [331/400]

pair	(	6	,
		19	,
		:
	)

pair() [332/400]

pair	(	6	,
		2	,
		:
	)

pair() [333/400]

pair	(	6	,
		20	,
		:
	)

pair() [334/400]

pair	(	6	,
		3	,
		:
	)

pair() [335/400]

pair	(	6	,
		4	,
		:
	)

pair() [336/400]

pair	(	6	,
		5	,
		:
	)

pair() [337/400]

pair	(	6	,
		6	,
		:
	)

pair() [338/400]

pair	(	6	,
		7	,
		:
	)

pair() [339/400]

pair	(	6	,
		8	,
		:
	)

pair() [340/400]

pair	(	6	,
		9	,
		:
	)

pair() [341/400]

pair	(	7	,
		1	,
		:
	)

pair() [342/400]

pair	(	7	,
		10	,
		:
	)

pair() [343/400]

pair	(	7	,
		11	,
		:
	)

pair() [344/400]

pair	(	7	,
		12	,
		:
	)

pair() [345/400]

pair	(	7	,
		13	,
		:
	)

pair() [346/400]

pair	(	7	,
		14	,
		:
	)

pair() [347/400]

pair	(	7	,
		15	,
		:
	)

pair() [348/400]

pair	(	7	,
		16	,
		:
	)

pair() [349/400]

pair	(	7	,
		17	,
		:
	)

pair() [350/400]

pair	(	7	,
		18	,
		:
	)

pair() [351/400]

pair	(	7	,
		19	,
		:
	)

pair() [352/400]

pair	(	7	,
		2	,
		:
	)

pair() [353/400]

pair	(	7	,
		20	,
		:
	)

pair() [354/400]

pair	(	7	,
		3	,
		:
	)

pair() [355/400]

pair	(	7	,
		4	,
		:
	)

pair() [356/400]

pair	(	7	,
		5	,
		:
	)

pair() [357/400]

pair	(	7	,
		6	,
		:
	)

pair() [358/400]

pair	(	7	,
		7	,
		:
	)

pair() [359/400]

pair	(	7	,
		8	,
		:
	)

pair() [360/400]

pair	(	7	,
		9	,
		:
	)

pair() [361/400]

pair	(	8	,
		1	,
		:
	)

pair() [362/400]

pair	(	8	,
		10	,
		:
	)

pair() [363/400]

pair	(	8	,
		11	,
		:
	)

pair() [364/400]

pair	(	8	,
		12	,
		:
	)

pair() [365/400]

pair	(	8	,
		13	,
		:
	)

pair() [366/400]

pair	(	8	,
		14	,
		:
	)

pair() [367/400]

pair	(	8	,
		15	,
		:
	)

pair() [368/400]

pair	(	8	,
		16	,
		:
	)

pair() [369/400]

pair	(	8	,
		17	,
		:
	)

pair() [370/400]

pair	(	8	,
		18	,
		:
	)

pair() [371/400]

pair	(	8	,
		19	,
		:
	)

pair() [372/400]

pair	(	8	,
		2	,
		:
	)

pair() [373/400]

pair	(	8	,
		20	,
		:
	)

pair() [374/400]

pair	(	8	,
		3	,
		:
	)

pair() [375/400]

pair	(	8	,
		4	,
		:
	)

pair() [376/400]

pair	(	8	,
		5	,
		:
	)

pair() [377/400]

pair	(	8	,
		6	,
		:
	)

pair() [378/400]

pair	(	8	,
		7	,
		:
	)

pair() [379/400]

pair	(	8	,
		8	,
		:
	)

pair() [380/400]

pair	(	8	,
		9	,
		:
	)

pair() [381/400]

pair	(	9	,
		1	,
		:
	)

pair() [382/400]

pair	(	9	,
		10	,
		:
	)

pair() [383/400]

pair	(	9	,
		11	,
		:
	)

pair() [384/400]

pair	(	9	,
		12	,
		:
	)

pair() [385/400]

pair	(	9	,
		13	,
		:
	)

pair() [386/400]

pair	(	9	,
		14	,
		:
	)

pair() [387/400]

pair	(	9	,
		15	,
		:
	)

pair() [388/400]

pair	(	9	,
		16	,
		:
	)

pair() [389/400]

pair	(	9	,
		17	,
		:
	)

pair() [390/400]

pair	(	9	,
		18	,
		:
	)

pair() [391/400]

pair	(	9	,
		19	,
		:
	)

pair() [392/400]

pair	(	9	,
		2	,
		:
	)

pair() [393/400]

pair	(	9	,
		20	,
		:
	)

pair() [394/400]

pair	(	9	,
		3	,
		:
	)

pair() [395/400]

pair	(	9	,
		4	,
		:
	)

pair() [396/400]

pair	(	9	,
		5	,
		:
	)

pair() [397/400]

pair	(	9	,
		6	,
		:
	)

pair() [398/400]

pair	(	9	,
		7	,
		:
	)

pair() [399/400]

pair	(	9	,
		8	,
		:
	)

pair() [400/400]

pair	(	9	,
		9	,
		:
	)

Variable Documentation

ALA

ALA

ARG

ARG

ASN

ASN

ASP

ASP

CYS

CYS

env

env = zeros(20,40)

Referenced by FloppyTailMover::FloppyTailMover(), get_loop_scorefxn(), get_loop_scorefxn_old(), gpu_refold_test(), initialize_free_and_fixed(), main(), RBSegmentRelax_test(), simple_centroid_test(), simple_loop_modeling_test(), simple_opte_test(), and test_chunk().

function

function[list, pair, env]

Initial value:

= load_pair_env_table()
list = [ 
 "GLU"

GLN

GLN

GLY

GLY

HIS

HIS

ILE

ILE

LEU

LEU

LYS

LYS

MET

MET

pair

i j : pair = zeros(20,20,30)

Referenced by add_histograms_together(), bind_std_functional_hash(), bind_std_stl_multiset(), bind_std_unordered_map(), bind_T42_stl_names_map(), bind_T42_stl_names_multi(), bind_T42_stl_names_multimap(), dist(), doit(), FloppyTailMover::FloppyTailMover(), get_loop_scorefxn(), get_loop_scorefxn_old(), utility::json_spirit::Config_vector< String >::get_name(), utility::json_spirit::Config_map< String >::get_name(), utility::json_spirit::Config_vector< String >::get_value(), utility::json_spirit::Config_map< String >::get_value(), go_main(), gpu_refold_test(), initialize_free_and_fixed(), initialize_from_pdb(), input_coordCstsMapped(), main(), parse_nonstandard_angles(), parse_nonstandard_bondlengths(), perturb(), RBSegmentRelax_test(), core::pack::annealer::FixbbSimAnnealer::run(), simple_centroid_test(), simple_loop_modeling_test(), and simple_opte_test().

PHE

PHE

PRO

PRO

SER

SER

THR

THR

TRP

TRP

TYR

TYR

VAL

VAL