Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- m -

• m_inv_gen() : core::scoring
• maca : core::scoring::rna::chemical_shift
• magnetic_anisotropy_effect() : core::scoring::rna::chemical_shift
• make_asymmetric_pose() : core::pose::symmetry
• make_atom_map() : core::pose
• make_hbBasetoAcc_unitvector() : core::scoring::hbonds
• make_new_symmetric_PackerTask_by_intersection() : core::pack
• make_new_symmetric_PackerTask_by_requested_method() : core::pack
• make_new_symmetric_PackerTask_by_truncation() : core::pack
• make_new_symmetric_PackerTask_by_union() : core::pack
• make_pose_from_frags() : core::fragment
• make_pose_from_saccharide_sequence() : core::pose
• make_pose_from_sequence() : core::pose
• make_pose_from_sequence_() : core::fragment
• make_residue_mask_symmetric() : core::pose::symmetry
• make_score_function_consistent_with_symmetric_state_of_pose() : core::pose::symmetry
• make_simple_fold_tree_from_jump_frame() : core::fragment
• make_sure_full_model_info_is_setup() : core::pose::full_model_info
• make_symmetric_movemap() : core::pose::symmetry
• make_symmetric_PackerTask_by_truncation() : core::pack
• make_symmetric_pdb_info() : core::pose::symmetry
• make_symmetric_pose() : core::pose::symmetry
• map_char_to_torsion_bin() : core::conformation
• map_of_weighted_scores() : core::import_pose::atom_tree_diffs
• map_seq1_seq2() : core::sequence
• map_string_to_torsion_bin_string() : core::conformation
• map_to_comma_strings() : core::conformation::symmetry
• map_torsion_bin_to_char() : core::conformation
• mapping_to_alignment() : core::sequence
• maqw : core::scoring::rna::chemical_shift
• maqx : core::scoring::rna::chemical_shift
• maqy : core::scoring::rna::chemical_shift
• maqz : core::scoring::rna::chemical_shift
• marx : core::scoring::rna::chemical_shift
• mary : core::scoring::rna::chemical_shift
• marz : core::scoring::rna::chemical_shift
• maskbits : core::scoring , core::scoring::packstat::old
• masks() : core::scoring , core::scoring::packstat::old , core::scoring::sasa
• Mass : core
• mass() : core::pose
• Mat : core::conformation::symmetry , core::scoring::motif
• MATCH_AA : core::scoring::motif
• MATCH_ANY : core::scoring::motif
• MATCH_HYDROPHOBICITY : core::scoring::motif
• MATCH_ROTAMER : core::scoring::motif
• Matrix : core::pose::rna , core::scoring::dna
• matrix : core::scoring
• Matrix : core::scoring::rna
• MAX_CHEMICAL_BOND_TO_HYDROGEN_LENGTH : core::chemical
• MAX_FLT : core::scoring::electron_density , core::scoring::electron_density_atomwise
• MAX_HB_ENERGY : core::scoring::hbonds
• max_possible_LK : core::scoring::geometric_solvation
• MAX_R : core::scoring::hbonds
• MAX_R2 : core::scoring::hbonds
• max_rad() : core::scoring::packstat
• MAX_xD : core::scoring::hbonds
• MAX_xH : core::scoring::hbonds
• Mcbeta : core::scoring
• Md : core::chemical::element
• MEM : core::conformation::membrane
• mem_anchor() : core::conformation::membrane
• mem_center : core::conformation::membrane
• mem_jump() : core::conformation::membrane
• mem_normal : core::conformation::membrane
• mem_steepness : core::conformation::membrane
• mem_thickness : core::conformation::membrane
• MEMB_HIGHRES_WTS : core::scoring
• MembEtableCAP : core::scoring::etable
• MembEtableOP : core::scoring::etable
• Membrane_FAEmbed_from_pose() : core::scoring
• Membrane_FAEmbedCOP : core::scoring
• Membrane_FAEmbedOP : core::scoring
• Membrane_FAPotentialCOP : core::scoring
• Membrane_FAPotentialOP : core::scoring
• MembraneCbetaEnergyCreator_registrator : core::init
• MembraneCenPairEnergyCreator_registrator : core::init
• MembraneDataCOP : core::scoring::membrane
• MembraneDataOP : core::scoring::membrane
• MembraneEmbed_from_pose() : core::scoring
• MembraneEmbedCOP : core::scoring
• MembraneEmbedOP : core::scoring
• MembraneEnvEnergyCreator_registrator : core::init
• MembraneEnvPenaltiesCreator_registrator : core::init
• MembraneEnvSmoothEnergyCreator_registrator : core::init
• MembraneInfoCOP : core::conformation::membrane
• MembraneInfoOP : core::conformation::membrane
• MembraneLipoCreator_registrator : core::init
• MembranePotentialCOP : core::scoring
• MembranePotentialOP : core::scoring
• MembraneTopology_from_pose() : core::scoring
• MembraneTopologyCOP : core::scoring
• MembraneTopologyOP : core::scoring
• Menv : core::scoring
• Menv_non_helix : core::scoring
• Menv_smooth : core::scoring
• Menv_termini : core::scoring
• Menv_tm_proj : core::scoring
• merge_constraints_from_cmdline() : core::scoring::constraints
• merge_constraints_from_cmdline_to_pose() : core::scoring::constraints
• merge_constraints_from_cmdline_to_scorefxn() : core::scoring::constraints
• merge_csts_to_scorefunction() : core::scoring::constraints
• merge_fa_constraints_from_cmdline() : core::scoring::constraints
• merge_fa_constraints_from_cmdline_to_pose() : core::scoring::constraints
• merge_fa_constraints_from_cmdline_to_scorefxn() : core::scoring::constraints
• merge_frags() : core::fragment
• metalhash_constraint : core::scoring
• Mg : core::chemical::element
• mg_ref : core::scoring
• min_mod() : core::scoring::electron_density
• MIN_OCC_ENERGY : core::scoring::geometric_solvation
• min_pack() : core::pack
• min_pack_optimize() : core::pack
• min_pack_place_opt_rotamers_on_pose() : core::pack
• min_pack_setup() : core::pack
• min_pair_data : core::scoring
• MIN_R : core::scoring::hbonds
• MIN_R2 : core::scoring::hbonds
• min_single_data : core::scoring
• MIN_xD : core::scoring::hbonds
• MIN_xH : core::scoring::hbonds
• MinimizationGraphCOP : core::scoring
• MinimizationGraphOP : core::scoring
• minimize_alt_rotamer() : core::pack
• MinimizerMapBaseCOP : core::kinematics
• MinimizerMapBaseOP : core::kinematics
• MinimizerMapCOP : core::optimization
• MinimizerMapOP : core::optimization
• MinimizerOptionsCOP : core::optimization
• MinimizerOptionsOP : core::optimization
• MiniPoseAP : core::pose
• MiniPoseCAP : core::pose
• MiniPoseCOP : core::pose
• MiniPoseOP : core::pose
• minirosetta_svn_url() : core
• minirosetta_svn_version() : core
• MinMultiHarmonicFuncCOP : core::scoring::func
• MinMultiHarmonicFuncOP : core::scoring::func
• MinScoreScoreFunctionCOP : core::scoring
• MinScoreScoreFunctionOP : core::scoring
• mioAD : core::chemical::sdf
• mioBD : core::chemical::sdf
• missing_O2prime() : core::io::pdb
• missing_res : core::scoring
• MissingEnergyCreator_registrator : core::init
• MixtureFuncOP : core::scoring::func
• Mlipo : core::scoring
• mm_bend : core::scoring
• mm_bond_angle_residue_type_param_set() : core::scoring::mm
• mm_bondangle_atom_tri : core::scoring::mm
• mm_bondangle_library : core::scoring::mm
• mm_bondangle_library_citer : core::scoring::mm
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• mm_lj_energy_inter_method : core::scoring::methods
• mm_lj_inter_atr : core::scoring
• MM_LJ_INTER_NBLIST : core::scoring::EnergiesCacheableDataType
• mm_lj_inter_rep : core::scoring
• mm_lj_intra_atr : core::scoring
• MM_LJ_INTRA_NBLIST : core::scoring::EnergiesCacheableDataType
• mm_lj_intra_rep : core::scoring
• mm_lj_param_set : core::scoring::mm
• MM_LJ_TRIE_COLLECTION : core::scoring::EnergiesCacheableDataType
• MM_STD_WTS : core::scoring
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• Mn : core::chemical::element
• Mo : core::chemical::element
• modify_atom_properties_from_command_line() : core::chemical
• MolecularSurfaceCalculatorCOP : core::scoring::sc
• MolecularSurfaceCalculatorOP : core::scoring::sc
• MolFileIOAtomCOP : core::chemical::sdf
• MolFileIOAtomOP : core::chemical::sdf
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• MoveMapOP : core::kinematics
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• Mt : core::chemical::element
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• MultiConstraintCreator_registrator : core::init
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