Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- c -

• c_cstring : ObjexxFCL , ObjexxFCL::format
• CA() : PhiPsi
• CA_DME_EVALUATION : basic
• CA_MODEL : clean_pdb_keep_ligand
• CA_RMSD_EVALUATION : basic
• CA_xyz : test::Workshop2test
• CacheableDataAP : basic::datacache
• CacheableDataCAP : basic::datacache
• CacheableDataCOP : basic::datacache
• CacheableDataOP : basic::datacache
• CacheableStringAP : basic::datacache
• CacheableStringCAP : basic::datacache
• CacheableStringCOP : basic::datacache
• CacheableStringFloatMapAP : basic::datacache
• CacheableStringFloatMapCAP : basic::datacache
• CacheableStringFloatMapCOP : basic::datacache
• CacheableStringFloatMapOP : basic::datacache
• CacheableStringMapAP : basic::datacache
• CacheableStringMapCAP : basic::datacache
• CacheableStringMapCOP : basic::datacache
• CacheableStringMapOP : basic::datacache
• CacheableStringOP : basic::datacache
• calc_binding_energy() : demo::D090_Ala_scan
• calc_quadratic() : basic
• calc_rms() : numeric::model_quality
• calc_rms_fast() : numeric::model_quality
• calcCAcentroid() : loadPDB
• calculate_source_modification_date() : BuildBindings
• CalculatorOP : numeric
• calls : basic
• candidate_target_library : BuildPackagedBindings
• candidate_target_modules : BuildPackagedBindings
• CANONICALMOVER_WRITE_TO_FILE : basic
• CArray_bool : ObjexxFCL
• CArray_byte : ObjexxFCL
• CArray_char : ObjexxFCL
• CArray_double : ObjexxFCL
• CArray_float : ObjexxFCL
• CArray_Fstring : ObjexxFCL
• CArray_int : ObjexxFCL
• CArray_long : ObjexxFCL
• CArray_longdouble : ObjexxFCL
• CArray_sbyte : ObjexxFCL
• CArray_schar : ObjexxFCL
• CArray_short : ObjexxFCL
• CArray_size : ObjexxFCL
• CArray_size_t : ObjexxFCL
• CArray_string : ObjexxFCL
• CArray_ubyte : ObjexxFCL
• CArray_uchar : ObjexxFCL
• CArray_uint : ObjexxFCL
• CArray_ulong : ObjexxFCL
• CArray_ushort : ObjexxFCL
• CArrayP_bool : ObjexxFCL
• CArrayP_byte : ObjexxFCL
• CArrayP_char : ObjexxFCL
• CArrayP_double : ObjexxFCL
• CArrayP_float : ObjexxFCL
• CArrayP_Fstring : ObjexxFCL
• CArrayP_int : ObjexxFCL
• CArrayP_long : ObjexxFCL
• CArrayP_longdouble : ObjexxFCL
• CArrayP_sbyte : ObjexxFCL
• CArrayP_schar : ObjexxFCL
• CArrayP_short : ObjexxFCL
• CArrayP_size : ObjexxFCL
• CArrayP_size_t : ObjexxFCL
• CArrayP_string : ObjexxFCL
• CArrayP_ubyte : ObjexxFCL
• CArrayP_uchar : ObjexxFCL
• CArrayP_uint : ObjexxFCL
• CArrayP_ulong : ObjexxFCL
• CArrayP_ushort : ObjexxFCL
• CASE_SENSITIVE() : platform::file
• ccd : test::Workshop8test
• ccd_angle() : numeric
• CCD_CLOSE : basic
• ccd_closure : loops
• cdrs : test::G201_Module_Structure
• cen_relax : app::surface_docking::surface_docking
• center() : numeric , ObjexxFCL
• center_at_origin() : loadPDB
• center_of_mass() : numeric
• center_of_mass_binned : numeric::geometry::hashing
• centered() : ObjexxFCL
• centerG_P() : app::surface_docking::surf_param
• centerG_S() : app::surface_docking::surf_param
• cerr : utility::io::oc
• chain_from_iterables() : arls_impl
• chainid : clean_pdb_keep_ligand
• chainids : toolbox::make_rna_rosetta_ready
• chainParams() : numeric::kinematic_closure , numeric::kinematic_closure::radians
• chainTORS() : numeric::kinematic_closure , numeric::kinematic_closure::radians
• chainXYZ() : numeric::kinematic_closure , numeric::kinematic_closure::radians
• CHAR() : ObjexxFCL::Fortran
• char_equali() : ObjexxFCL , utility::file
• char_of() : ObjexxFCL
• chat : basic::options
• check_and_print_pdb() : clean_pdb_keep_ligand
• check_cast() : basic
• CHECK_COMM_SIZE : basic
• check_statement_sanity() : basic::database
• CHEMICAL_MAKE_POSE : basic
• chm : test::T100_Basic
• ChunkVector_bool : ObjexxFCL
• ChunkVector_byte : ObjexxFCL
• ChunkVector_char : ObjexxFCL
• ChunkVector_double : ObjexxFCL
• ChunkVector_float : ObjexxFCL
• ChunkVector_Fstring : ObjexxFCL
• ChunkVector_int : ObjexxFCL
• ChunkVector_long : ObjexxFCL
• ChunkVector_longdouble : ObjexxFCL
• ChunkVector_sbyte : ObjexxFCL
• ChunkVector_schar : ObjexxFCL
• ChunkVector_short : ObjexxFCL
• ChunkVector_size : ObjexxFCL
• ChunkVector_size_t : ObjexxFCL
• ChunkVector_string : ObjexxFCL
• ChunkVector_ubyte : ObjexxFCL
• ChunkVector_uchar : ObjexxFCL
• ChunkVector_uint : ObjexxFCL
• ChunkVector_ulong : ObjexxFCL
• ChunkVector_ushort : ObjexxFCL
• cin : utility::io::ic
• circle : test::Workshop9test
• circle2 : test::Workshop9test
• citation() : app::pyrosetta_toolkit::modules::help
• clamp() : numeric
• CLANG_XML() : tools::CppParser
• class_from_full_path() : exclude
• class_of() : exclude
• classifiers : app::pyrosetta_toolkit::modules::prettytable::setup
• clean_whitespace() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::output
• cleanATOM() : toolbox , toolbox::cleaning
• cleanCRYS() : toolbox , toolbox::cleaning
• clearLists() : app::pyrosetta_toolkit::window_modules::protocol_builder::ProtocolBuilder
• clock_factor : basic
• clog : utility::io::oc
• closest_point_on_line() : numeric
• ClusteringTreeNodeAP : numeric
• ClusteringTreeNodeOP : numeric
• cmd : PlotSurfaceContactMap
• code_from_6bit() : utility
• code_to_6bit() : utility
• COLOR_LIB : PyMOLPyRosettaServer
• coloring_demo() : PyMOL_demo
• colors : test::T150_PyMOL_Integration
• ColumnCOP : basic::database::schema_generator
• ColumnOP : basic::database::schema_generator
• Columns : basic::database::schema_generator
• COMAS() : numeric::model_quality
• combine_identical_chains() : loadPDB
• combine_names() : utility::file
• combined_pose : app::surface_docking::surface_docking
• COMM_REDUCE_SIZE : basic
• COMMA : numeric::expression_parser
• comma_seperated_string_to_xyz() : numeric
• comparable() : ObjexxFCL , utility::keys
• compare_hbonds() : toolbox::mutants
• compare_mutants__() : toolbox::mutants
• compare_residue_energies_all : local
• compare_residue_energies_mut : local
• compare_sequences() : toolbox::mutants
• compare_times() : compare_times
• compose() : yaml
• compose_all() : yaml
• CompoundInterpolatorCOP : numeric::interpolation::spline
• CompoundInterpolatorOP : numeric::interpolation::spline
• compress() : ObjexxFCL
• compute_ddG() : mp_ddG , predict_ddG
• compute_plane_positions() : PyMOLPyRosettaServer
• Con : ContactMap
• cond_exit() : utility
• condenseReslist() : loadPDB
• config : src
• Config : utility::json_spirit
• config_file_name : src
• CONFORMATION_COPY : basic
• CONFORMATION_DETECT_DISULF : basic
• CONFORMATION_FIX_DISULF : basic
• connect_points() : PyMOLPyRosettaServer
• ConstDataMapCOP : basic::datacache
• ConstDataMapOP : basic::datacache
• CONSTRAINT_SCORE : basic
• CONSTRAINT_SET_COPY : basic
• ConstraintCOP : basic::database::schema_generator
• ConstraintOP : basic::database::schema_generator
• constraints : app::surface_docking::surface_docking
• CONSTRUCT_DISTANCE_MATRIX : basic
• construct_kd_tree() : numeric::kdtree
• contactAtoms : calccontacts
• contactFilter : calccontacts
• ContactList() : PlotSurfaceContactMap
• ContactMap() : ContactMap
• contactObject : contacts
• contactType : calccontacts
• context : tools::CppParser
• convert_array_to_str() : mp_ddG , predict_ddG
• convert_PDBLIST_to_sqlite3db() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::output
• convert_to_loadedPDB() : loadPDB
• coord_angle() : coordlib
• Coordinate : numeric::kinematic_closure
• CoordinateList : numeric::kinematic_closure
• coordinates() : PDBInfo , PhiPsi
• COPY_COORDS : basic
• copy_header_directory() : BuildPackagedBindings
• copy_tree_contents() : BuildPackagedBindings
• copysign() : utility
• corr_int() : loadPDB
• corrcoef() : numeric::statistics
• corrcoef_with_provided_mean_and_std_dev() : numeric::statistics
• cos_of() : numeric
• COSFXN() : numeric::crick_equations
• cot() : numeric
• count : clean_pdb_keep_ligand , toolbox::make_rna_rosetta_ready
• counter : demo::D060_Folding , demo::D100_Docking , demo::D110_DNA_interface , demo::D120_Ligand_interface
• cout : utility::io::oc
• cov() : numeric::statistics
• cov_with_provided_mean() : numeric::statistics
• create_blank_file() : utility::file
• create_directory() : utility::file
• create_directory_recursive() : utility::file
• create_extra_output() : apps::public1::scenarios::chemically_conjugated_docking
• create_temp_filename() : utility::file
• createRG() : numeric::random
• createSeqFile() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::output
• cross() : coordlib , numeric , numeric::kinematic_closure , numeric::kinematic_closure::radians , ObjexxFCL
• cross_product() : app::surface_docking::surf_param , Equations , numeric , ObjexxFCL , PhiPsi
• csc() : numeric
• CSI_bgBlack : utility
• CSI_bgBlue : utility
• CSI_bgCyan : utility
• CSI_bgGreen : utility
• CSI_bgMagenta : utility
• CSI_bgRed : utility
• CSI_bgWhite : utility
• CSI_bgYellow : utility
• CSI_Black : utility
• CSI_Blue : utility
• CSI_Bold : utility
• CSI_Cyan : utility
• CSI_Green : utility
• CSI_Magenta : utility
• CSI_Red : utility
• CSI_Reset : utility
• CSI_Underline : utility
• CSI_White : utility
• CSI_Yellow : utility
• cst_file : test::G100_Functions_Input
• cstring : ObjexxFCL , ObjexxFCL::format
• cube() : numeric , ObjexxFCL
• CubeSyms : basic::sampling::orientations
• cumulative() : numeric
• curr_ads : app::surface_docking::surface_docking
• curr_sol : app::surface_docking::surface_docking
• current_directory : app::pyrosetta_toolkit::window_main::global_variables
• current_lib_suffix : BuildPackagedBindings
• current_platform : BuildPackagedBindings
• current_platform_bits : BuildPackagedBindings
• cutpoint : loops
• cwd1 : app::surface_docking::surface_docking
• cwd2 : app::surface_docking::surface_docking
• cwdn : app::surface_docking::surface_docking
• cycles : demo::D060_Folding , demo::D070_Refinement
• cyclic : peptoid_design