- g -

• G() : ObjexxFCL::format
• gamma_increment() : sample_around
• gapspan() : loops
• gaussian() : numeric::random
• gaussian_random_xform() : numeric::random
• GCC_XML_main() : tools::CppParser
• gcd() : numeric , ObjexxFCL
• gdtmm() : cluster , evaluation
• gdttm() : evaluation
• ge_tol() : numeric , ObjexxFCL
• gen_pep_bb_sequential() : pepspec
• gen_pharmacophore() : gen_pharmacophore
• gen_reverse_motifs_on_load() : mh
• general() : ObjexxFCL::format
• general_dihedral_cst_phi_sd() : antibody
• general_dihedral_cst_psi_sd() : antibody
• general_Fstring_of() : ObjexxFCL
• general_string_of() : ObjexxFCL
• generate_bindings() : build
• generate_cmake_file() : build
• generate_comment_for_declaration() : binder
• generate_documentation_string_for_declaration() : binder
• generate_include_directives() : binder
• generate_monolith_main() : tools::CppParser
• generate_monolith_module() : tools::CppParser
• generate_nonstandard_residue_set() : demo::D120_Ligand_interface , pyrosetta , pyrosetta::toolbox::load_ligand , src , toolbox::load_ligand
• generate_one_model() : loadPDB
• generate_resfile_from_pdb() : demo::D050_Packer_task , pyrosetta::toolbox::generate_resfile , pyrosetta::toolbox , toolbox::generate_resfile , toolbox
• generate_resfile_from_pose() : demo::D050_Packer_task , pyrosetta::toolbox::generate_resfile , pyrosetta::toolbox , toolbox::generate_resfile , toolbox
• generate_rosetta_cmake_files() : build
• generate_rosetta_external_cmake_files() : build
• generateIncludes() : tools::CppParser
• generatePDB() : loadPDB
• generations() : ms
• generic_aa() : remodel
• generic_job_name() : jd2
• generous_hbonds() : bunsat_calc2
• genkic_closure_attempts() : cyclic_peptide
• genkic_min_solution_count() : cyclic_peptide
• geom_csts_downstream_output() : match
• geom_sol_interres_path_distance_cutoff() : score
• geom_sol_intrares_path_distance_cutoff() : score
• geometric_constraint_file() : match
• get() : fmt::internal , ObjexxFCL
• get_all_exit_callbacks() : utility
• get_all_rosetta_objs() : BuildBindings
• get_atom2_num() : make_amb_constr
• get_binding_build_root() : build
• get_boolean_option() : basic::options
• get_boolean_vector_option() : basic::options
• get_class_bases() : exclude
• get_cluster_data() : numeric
• get_compiler_defines() : BuildBindings
• get_compiler_family() : build
• get_current_dylib_path() : toolbox::adjust_library_path
• get_db_session() : basic::database
• get_decl_dependencies() : binder
• get_defines() : build
• get_direct_childrens() : tools::CppParser
• get_ends() : PyMOLPyRosettaServer
• get_file_list() : setup
• get_file_option() : basic::options
• get_file_vector_option() : basic::options
• get_func_def() : make_amb_constr
• get_hbonds() : pyrosetta::toolbox , toolbox
• get_include() : src
• get_index() : loadPDB
• get_int() : utility::json_spirit
• get_integer_option() : basic::options
• get_integer_vector_option() : basic::options
• get_lines_from_file_data() : utility::io
• get_markers() : app::surface_docking::surf_param
• get_mArray() : utility::json_spirit
• get_mObject() : utility::json_spirit
• get_num_digits() : utility
• get_option() : basic::options
• get_option_from_map() : basic::resource_manager
• get_pdb_list_from_dir() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::input
• get_percentile_bounds() : numeric::kdtree
• get_procs_per_case() : arls_impl
• get_profile_fname() : setup_pyrosetta
• get_pymol_chain() : basic
• get_pymol_chain_index_1() : basic
• get_pymol_num_unique_ids() : basic
• get_real() : utility::json_spirit
• get_real_option() : basic::options
• get_real_vector_option() : basic::options
• get_residuetypeset_from_path_array() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::input
• get_resnum_and_chain() : utility
• get_resnum_and_chain_from_one_tag() : utility
• get_resnum_and_segid() : utility
• get_resnum_and_segid_from_one_tag() : utility
• get_resource() : basic::resource_manager
• get_rosetta_database_path() : pyrosetta , src
• get_rosetta_include_directories() : build
• get_rosetta_system_include_directories() : build
• get_scratch_buff() : numeric::fourier
• get_secstruct() : pyrosetta::toolbox , toolbox
• get_sequence() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::sequence
• get_set_from_datamap() : basic::datacache
• get_str() : utility::json_spirit
• get_str_() : utility::json_spirit
• get_string() : utility::json_spirit
• get_string_option() : basic::options
• get_string_or_empty() : utility::json_spirit
• get_string_vector_option() : basic::options
• get_test_files() : self-test
• get_text() : binder
• get_tmp_buff() : numeric::fourier
• get_type_dependencies() : binder
• get_undefined_real() : utility
• get_undefined_size() : utility
• get_usage_from_procfilesystem() : basic
• get_value() : utility::json_spirit , utility::json_spirit::internal_
• get_vc_compile_options() : BuildBindings
• get_vc_link_options() : BuildBindings
• get_windows_compile_command_line() : BuildBindings
• get_windows_link_command_line() : BuildBindings
• getAllRosettaSourceFiles() : BuildBindings
• GetAtoms() : PDBInfo
• GetAtomTypeInfo() : PDBInfo
• getCAlist() : loadPDB
• getCentroid() : loadPDB
• getCompilerOptions() : BuildBindings , BuildPackagedBindings
• getContext() : tools::CppParser
• getDist() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::general_tools
• getDistGen() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::general_tools
• getDoxygenComment() : tools::doxygen
• getDoxygenPage() : options_class
• getFile() : tools::CppParser
• getFragLists() : app::pyrosetta_toolkit::window_modules::protocol_builder::ProtocolBuilder
• getIncludes() : exclude
• getKind() : tools::CppParser
• getLigands() : loadPDB
• getline() : ObjexxFCL , utility::io
• getLinkerOptions() : BuildBindings , BuildPackagedBindings
• getMapFunction() : make_templates
• getMarkdownPage() : options_class
• getNameSpace() : exclude
• getOS() : app::pyrosetta_toolkit::modules::tools::general_tools
• getpagesize() : fmt
• getPlatformIncludePath() : BuildPackagedBindings
• getProtocolLists() : app::pyrosetta_toolkit::window_modules::protocol_builder::ProtocolBuilder
• getPureTypeName() : tools::CppParser
• GetResidueAtoms() : PDBInfo
• getSequence() : loadPDB
• getVectorFunction() : make_templates
• ghost_loops() : stepwise::protein
• give_up() : fast_loops
• global_atom_pair_cst_scoring() : antibody::design
• global_dihedral_cst_scoring() : antibody::design
• global_optimize() : stepwise::protein
• global_sample_res_list() : stepwise::rna
• glycam_pdb_format() : carbohydrates
• glycan_branches() : carbohydrates::clash_check
• glycan_relax() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_kt() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_movie() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_random_start() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_rounds() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_sugar_bb_start() : carbohydrates::glycan_relax
• glycan_relax_test() : carbohydrates::glycan_relax
• gpu() : gpu
• gpu_processor() : score::fiber_diffraction
• gradnorm() : numeric::crick_equations
• gradual_constraints() : rna::farna
• graft_h1() : antibody
• graft_h2() : antibody
• graft_h3() : antibody
• graft_l1() : antibody
• graft_l2() : antibody
• graft_l3() : antibody
• grafting_database() : antibody
• graphics() : boinc
• grid() : docking::ligand::grid
• grid_angle_multiplier() : lh
• grid_boundary() : match
• grid_dir() : qsar
• grid_ensemble() : jd2
• grid_kin() : docking::ligand::grid
• grid_map() : docking::ligand::grid
• grid_nsamp_angle() : matdes::design
• grid_nsamp_radius() : matdes::design
• grid_phi() : score::fiber_diffraction
• grid_r() : score::fiber_diffraction
• grid_reso() : score::fiber_diffraction
• grid_size_angle() : matdes::design
• grid_size_radius() : matdes::design
• grid_space_multiplier() : lh
• grid_spacing() : edensity
• grid_vdw_weight() : rna::farna
• grid_z() : score::fiber_diffraction
• gridligpath() : loodo
• grouper_downstream_rmsd() : match
• grow_attempts() : loops
• grp_cpfxn() : score
• grpelec_context_dependent() : score
• grpelec_cpfxn_weight() : score
• grpelec_fade_hbond() : score
• grpelec_fade_param1() : score
• grpelec_fade_param2() : score
• grpelec_fade_type() : score
• grpelec_max_qeps() : score
• gt_tol() : numeric , ObjexxFCL
• GTPase_residue() : chemically_conjugated_docking
• GTPasepdb() : chemically_conjugated_docking
• guarantee_no_DNA() : in
• guess_disulfides() : demo::D060_Folding
• gunzip() : utility::file
• gush() : basic::options
• gz() : ms::checkpoint
• gzip() : utility::file